Hallo,
mit der 1. Installation, verheiratet sich das Medium = Festplatte (nicht die Partition, wie beim MBR) mit dem BIOS.
Daher kommt immer der Windows-Bootlader hoch. Mit Chance kannst Du dort deine (seperate) Linux Partition / System eintragen.
Abhilfe ist u.u. die F12 Auswahl, so im BIOS...